Jomala IK:s verksamhet innefattar fotboll, friidrott, skidning, volleyboll, orientering, innebandy och en fleridrottssektion under arbetsnamnet "idrott för alla".
Klubbens målsättning är att få barn och ungdomar att delta i fysiska aktiviteter från tidig ålder och att bedriva verksamheten i Jomala. Som klubbens hemmaarena fungerar Jomala kommuns idrottsanläggningar Vikingahallen och Vikingahallen. Jomala kommun stöder också föreningens verksamhet ekonomiskt via bidrag.
Organisationen består av en centralstyrelse samt undersektioner. Varje undersektion har en egen styrelse för sin verksamhet.